Beim Vergleich von Prepaid Handytarifen ist zunächst darauf zu achten, dass sämtliche anfallenden Kosten berücksichtigt werden. Neben den Nutzungsentgelten fallen meist noch einmalige Kosten für die Freischaltung der Karte und ggf. für ein Handy an, das oft mit einem Simlock versehen ist. Wer sich für eine Flatrate entscheidet sollte darüber hinaus prüfen, welche Leistungen durch diese Flatrate abgedeckt sind. Bei den besonders günstigen Flatrates handelt es sich oft so genannte Netzflatrates, die nur Gespräche zwischen Kunden des jeweiligen Anbieters beinhalten. Im Fall einer Datenflatrate für die mobile Internetnutzung ist zu beachten, dass nahezu sämtliche Tarife eine monatliche Begrenzung des Datenvolumens enthalten.
Die unterschiedliche technische Qualität der Netze wirkt sich spürbar nur bei Datentarifen aus. Hier ist zu prüfen, ob der langsame Dienst GPRS oder das erheblich schnellere UMTS genutzt werden kann. Ein wichtiger Hinweis in diesem Zusammenhang ist der, dass über Mobilfunkdiscounter auch für die sehr gut ausgebauten UMTS Netze Prepaid Handytarife angeboten werden, die nur die Nutzung von GPRS gestatten. Werbeaussagen wie „.. in bester D-Netz Qualität“ können also durchaus irreführend sein.
Wer jedoch nur telefonieren und SMS versenden möchte, braucht sich um die Netzqualität weniger Gedanken zu machen. Hier ist allerdings eine gewisse Aufmerksamkeit vonnöten, wenn Auslandsgespräche geführt werden sollen oder das Prepaid Handy auch im Ausland benötigt wird, da einige Prepaid Tarife nur Inlandsgespräche ermöglichen.
Schließlich sollte beachtet werden, welche Möglichkeiten zur Aufladung des Prepaid Guthabens die einzelnen Anbieter vorsehen. Sehr komfortabel ist das bei vielen Anbietern mögliche automatische Aufladen bei Erreichen eines bestimmten Minimalguthabens. Außerdem sollte eine Möglichkeit bestehen, das Guthaben im Notfall auch an Sonn- und Feiertagen schnell aufladen zu können, beispielsweise über an Kiosken und Tankstellen erhältliche Guthabenkarten.